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アガロースゲル電気泳動は、核酸の研究を含む研究および診断プロジェクトで使用される科学的手法です。それは科学者または技術者がそれらのサイズに従ってDNAのような荷電核酸分子を分離することを可能にし、そしてポリメラーゼ連鎖反応のような実験によって生成された生成物を分析するために使用される。それは、実行するのが安価であり、高速プロセスであり、そして分析されている核酸の回収を可能にするので、日常的に使用されている。
アガロースゲル電気泳動では、バンドで区切られた核酸を見ることができます (Comstock Images / Stockbyte / Getty Images)
ゲルを作る
必要なものをすべて集めて、70%エタノールできれいにしてください。品目には、ゲルキャストトレイ、粘着テープ、実験室グレードのアガロース、フラスコまたはシリンダー、10倍濃度(Tris-Borate-EDTA、TBE)ランバッファー、臭化エチジウム、染料、および分析するサンプルが含まれます。また、ゲル電気泳動槽と電源があることを確認してください。アガロースは、分析するDNAテープの適量を量り取り、それをTBE緩衝液と混合し、そしてマイクロ波で融解することによって調製される。一般に、1%から2%の溶液で、毎日の分子生物学で研究されている多くのDNA鎖を網羅するのに十分です。小さいDNAはより濃縮されたゲルを必要とし、一方大きいDNAはより希釈されたゲルを必要とします。アガロース溶液を臭化エチジウムと混合し、それは電気泳動手順の間に核酸に結合する。成形コームを挿入するのと同じように、この溶液をゲルのメルトトレーに注ぎ、混合物を固化させる。
ゲルを挿入して活性化する
ゲルをトレイから取り出し、ランバッファーを含むゲル電気泳動リザーバーに浸す。分析されるべきサンプルは染料と混合されそして櫛によって作られたゲルの中のウェルに置かれる。研究者が電気泳動の進行を見て生成された断片のサイズを決定することを可能にするためにマーカーまたはスケールも含まれる。それから電流がゲルに加えられ、それはサンプルをゲルの一端から他端へ移動させる。この過程で、サンプル中の核酸はサイズの異なる断片に分離し、大きな分子はウェルに近づき、小さな分子はゲルの反対側に移動します。
ゲルを分析する
電気泳動手順を終了した後、ゲルをリザーバから取り出し、蛍光性臭化エチジウムに結合する核酸断片を照らすUVトランスイルミネーターに入れる。これの写真を撮り、核酸のバンドをゲルを通って移動した距離に従って測定することができる。スケールはそれらを既知のサイズのバンドに分割し、分析中に研究者を導くために使用することができます。