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細胞呼吸は、細胞が糖と脂肪の分子を分解し、これらの反応によって放出されたエネルギーを別の形態に変換して、細胞の他の機能を供給するために容易に利用できるようにするプロセスです。細胞呼吸は、２つの主要な副産物または廃棄物を生み出すが、状況によっては、第３の種類の副産物も生み出す可能性がある。
二酸化炭素
細胞呼吸中に生成される最も重要な残留物は二酸化炭素です。最も一般的な単糖の1つであるグルコースの各分子は、好気的呼吸中に6分子の二酸化炭素を生成します（すなわち、細胞呼吸は酸素を含みます）。二酸化炭素は細胞膜を通って血流に拡散し、そこで肺に戻され呼気で放出されます。
水
水は細胞呼吸のもう一つの副産物です。好気的呼吸によるグルコース分子の分解は、6分子の水を生成します。しかし、二酸化炭素とは異なり、細胞や血液は主に水で構成されているため、水は特別な処理を必要とする無駄ではありません。
乳酸
細胞は、発酵または嫌気性呼吸と呼ばれるプロセスを介して、酸素を使用せずにグルコースからエネルギーを収集することもできます。特に筋肉は、例えばランニング中など、激しい運動の初期段階でこのプロセスに依存しています。この過程でグルコースは分解されてエネルギーとピルビン酸と呼ばれる2分子の有機化合物を生成し、それが化学的に乳酸に変化します。過剰な乳酸塩は徐々に血流によって肝臓に運ばれ、そこで肝臓からピルビン酸塩に変換されます。実行中に筋肉細胞で発生する発酵プロセスは、いくつかの点でアルコール発酵のプロセスと似ています。酵母は酸素がない状態で糖を代謝します。筋肉細胞は残留物として乳酸を放出し、酵母はエタノールアルコールを放出します。