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バイオ燃料、またはトウモロコシ、サトウキビ、ヤシの木、大豆などの植物から作られる燃料添加剤は、化石燃料への世界の依存を減らし、地球温暖化の原因となる炭素排出量を減らすための方程式の一部です。しかし、バイオ燃料の生産によって新たな一連の環境問題が発生し、石油や石炭と同じくらい（おそらくそれ以上）の二酸化炭素を生産する可能性があることが研究によって示されています。バイオ燃料の支持者はいくつかの問題を認識していますが、それらは産業や技術の発展によって解決されると信じています。
土地と水の問題
バイオ燃料を生産するために作物を栽培することは、天然資源と環境に大きな問題を引き起こします。トウモロコシ、サトウキビ、大豆、その他のバイオ燃料作物には大量の水が必要であり、それが農村部での不足を引き起こす可能性があります。農家はこれらの農園に化学農薬を使用しているため、動物の生息地にダメージを与えたり、有益な鳥や昆虫を傷つけたりする可能性があります。燃料主導の農園では大量の窒素に富んだ肥料も必要とされ、それらは最終的にそれらを海や湖に運ぶ流れに流れ込みます。肥料は、魚や他の動物に有毒となる可能性がある藻類の花をもたらします。藻の死滅と分解により、それらは水中の利用可能な酸素のほとんどを使用し、他の生物が生き残ることができないデッドゾーンを作り出します。
燃料と食べ物
科学者たちは、食料作物の焦点を燃料に変えることは世界中の食料不足を悪化させると警告しています。不足がない地域でさえ、バイオ燃料をターゲットにした作物の重点は穀物と穀物ベースの価格の上昇をもたらしました。
土地利用
バイオ燃料農園のための遊休地の伐採もまた問題を引き起こします。未使用の土地を栽培している農家は、土壌に埋もれた炭素を緩めて大気中に放出します。彼らはまた野生生物の生息地を破壊しているかもしれません。ボルネオなど世界の他の地域では、バイオ燃料油を生産するためにヤシの木を植えるために広い面積の熱帯雨林が伐採されました。重要な生息地が失われただけでなく、農家も泥炭湿原を燃やしてヤシのプランテーションのための場所を空けました。火事はまた、大気中に大量の二酸化炭素を放出しました。
費用
エネルギー議員は、炭素排出量を削減し、地球温暖化を減らすための再生可能な代替手段としてバイオ燃料を採用しました。しかし研究によると、バイオ燃料、特に大豆から作られたバイオディーゼルの生産と輸送は、従来のバイオ燃料の生産中に放出される二酸化炭素の最大4倍の量を生成する可能性があります。他の研究は、燃料作物に使用されている大量の肥料から蒸発するアンモニアに関連する健康上のリスクを指摘しています。ほこりの中に閉じ込められたアンモニア粒子は風によって拡散され、呼吸器の問題の広い範囲を引き起こす可能性があります。