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原生動物と細菌は、長い進化のエオンによって分離された、真核生物と原核生物の異なる生活領域に属します。それでも、地球上のすべての生命体のように、それらは共通の祖先を持ち、それゆえに興味深い類似点を持ちます。原生動物と細菌の両方の信じられないほどの多様性にもかかわらず、それらが共通しているものについていくつかの一般化をすることが可能です。
遺伝コード
原生生物、細菌および他のすべての生物では、いくつかの化学的塩基対DNA配列は特定のアミノ酸をコードする。このコードは、同じＤＮＡ配列が原生動物と細菌の両方において同じアミノ酸配列をコードするという意味で事実上普遍的である。例外は、ストップコドンではなく、ピロリシンをコードするためにＵＡＧ配列を使用するという事実を含み、これは他の生物において起こることである。それにもかかわらず、コードは主にバクテリアと原虫の間の著しい類似性です。
リボソーム
細菌と原生動物はどちらも最初にDNAをRNAに転写し、次にリボソームと呼ばれる複雑な構造を使用してそのRNAをタンパク質に翻訳します。繰り返しになりますが、彼らはこの類似性を他のあらゆる形態の生命と共有しています。リボソームの構造は細菌と原生動物のような真核生物の間でわずかに変化します。真核生物のリボソームとバクテリアとの違いを利用することによっていくつかの抗生物質がバクテリアを殺すので、この違いも重要です。
細胞膜
細菌も原生動物も、リン脂質と呼ばれる分子でできた細胞膜を持っています。バクテリアや原生動物のリン脂質は一方の端に水溶性基を、もう一方の端に不溶性テールを持っているので、細胞膜はこれらの成分の二重層によって形成されます。尾は二重層の中心に面しています。細菌はそれらの細胞膜に加えて細胞壁を有するが、いくつかの細菌は内膜および外膜を有する。
高度に保存されたプロセス
細菌と原生動物は、多くの生化学的プロセスにおいて驚くべき類似性を示しています。これは他のすべての生命体と非常に似ています。バクテリアと原生動物がグルコースを分解するために使用するプロセスは解糖と呼ばれます。それにはいくつかのバリエーションがありますが、解糖はほとんどすべての知られている有機体で起こります。同様に、DNA複製プロセスは細菌と原生動物の間で非常に似ていますが、若干の違いがあります。