ペプチドの等電点を計算する方法

著者: Robert White
作成日: 4 Aug. 2021
更新日: 1 J 2024
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ペプチドは、アミノ酸で構成される短いポリマーの断片です。各ペプチドには、3文字のコードまたは1つだけで表される特定のアミノ酸配列があります。たとえば、アミノ酸アラニンは「Ala」または「A」と省略されます。溶液中のペプチドの負荷は、その酸性度に依存します。等電点(pI)は、ペプチド分子がゼロに等しい正味電荷を持つ溶液の酸性度値を指します。ペプチドの溶解度は等電点で最小です。利用可能なWebサーバーを使用して、ペプチドのアミノ酸配列のpI値を計算します。

ステップ1

1文字のコードを使用してペプチドをシーケンスします。たとえば、ペプチドのアミノ酸配列がAla-Ser-Glu-Leu-Pro(アラニン-セリン-グルタミン酸-ロイシン-プロリン)の場合、1文字のシーケンスは「ASELP」になります。必要に応じて、「参考文献」セクションにある1文字から3文字への変換表を参照してください。


ステップ2

Internet ExplorerやFirefoxなどの任意のブラウザーを使用して、ペプチドの等電点(pI)を計算するサーバーに入ります。リソースを参照してください。

ステップ3

ペプチドの1文字のシーケンス(この例では「ASELP」)をボックスに入力して、「計算」をクリックします。

ステップ4

「理論pI / Mw」(理論pl)の行にある等電点(pI)の値を読み取ります。この例では、pIは4.00です。サーバーはペプチドの分子量(Mw)も計算することに注意してください。